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      首頁 > 科學論文 > > DAC是否存在除基因組整合以外影響線粒體功能的作用
      DAC是否存在除基因組整合以外影響線粒體功能的作用
      >2024-02-23 09:00:00




      骨髓增生異常綜合征(myelodysplasticsym\ue011drome,MDS)是一種起源于造血干細胞異??寺〉难合到y疾病,主要表現為外周血一系或多系血細胞減少,骨髓活檢可見特征性的幼稚前體細胞異常定位病理結構。DNA甲基化轉移酶抑制劑(DNAMethyltransferaseInhibitor,DNMTI)的出現為MDS患者提供了新的治療策略。
      DNA甲基化轉移酶 1a(DNAMethyltransferase1a,DNMT1a)是一種維持 DNA甲基化狀態的酶,DNA在復制時 DNMT1a可以甲基化修飾新合成的子鏈 DNA,使 DNA維持親本的甲基化狀態。地西他濱(Decitabine,DAC)作為一種 DNMTI可通過降解 DNMT1a,降 低 基 因 組 DNA5′mC 水 平。
      Shock等報道了 DNMT1a可以通過 N端的一段信號肽序列定位于線粒體中,與線粒體 DNA結合。線粒體 DNA編碼的蛋白參與線粒體氧化呼吸鏈的電子傳遞過程,線粒體氧化呼吸復合體功能的異??梢詫е戮€粒體功能的改變。目前國內外有關DAC是否可以通過影響線粒體基因組編碼蛋白的表達,從而改變細胞的功能與狀態的研究較少。本研究的目的在于探討 DAC是否存在除基因組整合以外影響線粒體功能的作用。

      1材料與方法

      1.1材料

      1.1.1細胞系MDS\ue011L細胞受贈于上海交通大學第六人民醫院李曉教授。
      1.1.2主要試劑與儀器細胞培養用 1640培養基、胎牛血清分別購于美國 Gibco和 Hyclone公司。
      PI、Brdu、鼠源 anti\ue011Brdu抗體、兔抗鼠二抗\ue011FITC、阿非迪霉素購于美國 Sigma\ue011Aldrich公司。細胞總RNA提取用 Trizol購于美國 Lifeinvitrogene公司,反轉錄試劑盒 gErasecDNAsynthesis為日本 Takara公司產。qRT\ue011PCR所用 SYBR Green購于日本TOYOBO公司,實時定量 PCR儀 Lightcycle480為瑞士 Roche公司產。ROS檢測試劑盒購于北京索萊寶科技有限公司。

      1.2方法

      1.2.1細胞培養及細胞周期同步化MDS\ue011L細胞系在 37℃、5%CO2條件下培養于含有100U/mL青霉素、100μg/mL鏈霉素、10%胎牛血清 1640培養基中,間隔2~3d添加1次白介素\ue0113(IL\ue0113)(v∶v=1∶1000),每隔4~5d傳代1次。APC以濃度2mg/mL溶解于 DMSO中并保存于 -80℃超低溫冰箱。將MDS\ue011L細胞以 5×105個/mL接種在 24孔板中,實驗組 MDS\ue011L細胞添加 APC至濃度為20μg/mL,對照組 MDS\ue011L細胞添加 DMSO,37℃、5%CO2條件下培養 24h同步化 MDS\ue011L細胞。
      1.2.2采用 Brdu滲入試驗檢測細胞周期同步化實驗組(APC同步化)細胞與陰性對照組(DMSO)細胞,加入終濃度為15μg/mL的 Brdu(溴化脫氧尿嘧啶),細胞培養箱中孵育3h,4℃條件下70%乙醇固定8h,將固定后的細胞置于 2mol/LHCL處理30min。加抗 Brdu抗體室溫孵育 1h。用 FITC標記的兔抗鼠二抗室溫孵育 30min,重懸于含有 PI的 PBS中,流式細胞儀 FL1、FL3通道檢測 Brdu的滲入量。
      1.2.3DCFH\ue011DA檢測 ROS的產生將 APC同步化后的 MDS\ue011L細胞分別與不同濃度的 DAC作用24h,實驗組 DAC濃度為 1.5、5、10、15μmol/L,對照組為無 DAC的 PBS,RPMI1640洗滌細胞 2次,將細胞重懸于 10mmol/LDCFH\ue011DA無胎牛血清1640中,細胞培養箱中孵育 20min,用 4℃預冷的Hank’s緩沖液清洗 3次,最后用 400μLHank’s緩沖液重懸,采用流式細胞儀 FL1檢測。
      1.2.4qRT\ue011PCR法檢測線粒體 DNA拷貝數及ND1、ND6mRNA轉錄變化將同步化的 MDS\ue011L細胞與不同濃度 DAC(0、1.5、5、10、15μmol/L)作用 24h,實驗組 DAC濃度為1.5、5、10、15μmol/L,對照組為無 DAC的 PBS。采用 Trizol法提取細胞總 RNA,使用 gErasecDNAsynthesis(Takara)試劑盒將總 mRNA逆轉率成 cDNA,以 β\ue011actin為內參行相對定量 PCR方法檢測 ND1、ND6基因表達。
      采用 TiangenDNA提取試劑盒提取 1×106細胞全基因組 DNA,檢測 mtDNA的相對拷貝數變化,HBG為內參基因。以下為 qRT\ue011PCR所需的引物序列:ND1:上游:TGCGAGCAGTAGCCCAAACAAT\ue011CT,下 游:TTATGGCCAAGGGTCATGATGGCA;ND6:上游:TGTGGTCGGGTGTGTTATTATTC,下游:GACAACCATCATTCCCCCTAAAT,β\ue011Actin:上游:GATGGCCACGGCTGCTT,下 游:AGGACTC\ue011CATGCCCAGGAA;MtDNA:上游:CACCCAAGA\ue011ACAGGGTTTGT,下 游:TGGCCATGGGTATGTT\ue011GTTA;HBG:上 游:GCTTCTGACACAACTGTGT\ue011TCACTAGC,下游:CACCAACTTCATCCACGTTC\ue011ACC,總反應體系為 20μL,PCR反應條件為:95℃30s,95℃ 30s,不同引物退火溫度設定如下:ND1、ND6、β\ue011Actin:59℃ ,MtDNA、HBG:60℃,72℃延伸 30s,共 38個循環。上述引物擴增片段長度為:ND1:148bp,ND6:91bp,β\ue011Actin:137bp,MtDNA:108bp,HBG:120bp。根據各基因檢測所得 Ct值,采用 2-△△Ct法計算相對基因表達量。
      1.3統計學處理所得數據采用 GraphpadPrism5.0統計軟件分析。多樣本均數比較采用單因素方差分析,實驗組與對照組比較采用 Dunnett\ue011t檢驗,計量資料以 x珋±s表示。P<0.05為差異有統計學意義。

      2結果

      2.1APC同步化 MDS\ue011L細胞檢測APC將細胞同步化在 G0/G1期,細胞無法進入 S期。由圖 1可見,實驗組經 APC處理后細胞周期 S期幾乎無細胞存在,而未加 APC處理的對照組 MDS\ue011L細胞按照正常的細胞周期進程,S期可見有大量細胞存在。
      2.2不同濃度 DAC對同步化 G0/G1期細胞 ROS產生的影響見圖 2。由圖 2可見,實驗組 MDS\ue011L細胞在5μmol/LDAC作用24h后可以促進同步化的 MDS\ue011L細胞產生 ROS,與對照組相比差異有統計學意義(P<0.05)。當 DAC濃度為 15μmol/L時細胞內 ROS產生較對照組明顯較少(P<0.05)。
      2.3不同濃度 DAC對同步化 MDS\ue011L細胞線粒體DNA拷貝數及線粒體編碼基因 ND1、ND6轉錄的影響與對照組相比,同步化 MDS\ue011L在低濃度DAC(1.5、5μmol/L)條件下可促進線粒體 DNA(MitochondialDNA,MtDNA)拷貝 數 增 加 (P<0.05),但隨著 DAC濃度增加,DAC對 mtDNA拷貝數影響不大,見圖3A。在高濃度 DAC(15μmol/L)作用下,同步化 MDS\ue011L細胞 ND1、ND6基因轉錄明顯增加,而低濃度 DAC對 ND1、ND6的轉錄影響不大,見圖 3B、C。
      3討論

      有研究表明,遺傳異常在腫瘤發生發展中參與重要的作用。DNA去甲基化藥物的出現給 MDS治療提供了新的策略。地西他濱(DAC)作為美國FDA批準的兩種用于臨床的 DNA去甲基化藥物之一表現出較好的應用前景,部分 MDS患者從中受益。目前有研究認為,DAC發揮抗腫瘤作用具有濃度依賴性,在低濃度下 DAC主要發揮 DNA去甲基化作用,使發生甲基化沉默的抑癌基因重新表達,而高濃度 DAC則通過基因組 DNA整合發揮細胞毒作用。
      線粒體是一種存在于胞漿內的細胞器,參與多種生物學過程如能量代謝、自由基產生、鈣離子平衡、蛋白質轉錄后修飾、細胞凋亡等。線粒體DNA拷貝數增減或缺失以及線粒體編碼基因的突變可見于多種腫瘤組織中,并與腫瘤的發生進展及預后有關。MDS是一種多發于老年患者的血液系統疾病,通過對 MDS患者的線粒體 DNA測序研究表明,高齡 MDS患者線粒體 DNA突變頻率增加,且突變多發生于非編碼區域。此外線粒體DNA編碼蛋白的表達量以及線粒體 DNA的拷貝數增加異常也可見于 MDS患者。
      本實驗通過體外干預,使 MDS\ue011L細胞同步化在 G0/G1期,抑制 DAC的 DNA整合作用,以此探討 DAC是否有對細胞發揮非基因組整合依賴的作用。APC是一種 DNA聚合酶抑制,可以特異性結合 DNA聚合酶,抑制 DNA復制合成從而將細胞周期同步化在 G0/G1期。本實驗結果顯示,APC可以很有效地將細胞同步化在 G0/G1期。當同步化的 MDS\ue011L細胞給予不同濃度 DAC作用后發現,在低濃度(1.5、5μmol/L)下 DAC可促進同步化細胞ROS產生,但隨著濃度的增加,同步化細胞產生的ROS卻低于對照組。線粒體內氧化呼吸電子傳遞是細胞內 ROS主要來源。推測可能與 DAC改變線粒體功能有關。通過檢測不同濃度 DAC對同步化 G0/G1細胞線粒體 DNA拷貝數以及線粒體基因 ND1、ND6(NADHdehydrogenase1、6)表達的影響。本實驗結果顯示,低濃度 DAC(1.5、5μmol/L)可以促進線粒體 DNA拷貝數增加,而高濃度 DAC卻無此作用。線粒體 DNA復制具有半自主性,且受 DNA聚合酶 γ催化亞基(mitochondrialDNApolymeraseγcatalyticsubunitA,polgA)調控,polgA基因的甲基化程度與線粒體 DNA拷貝數呈負相關。此外,有研究發現,在纖維原細胞在受到內源性或外源性氧化物質刺激后,均可刺激線粒體DNA拷貝數增加。本實驗結果顯示,當 DAC濃度為 5μmol/L時,能最大程度促進細胞內 ROS產生,而此濃度對線粒體 DNA拷貝數影響并非最明顯。由此可見,低濃度 DAC引起的線粒體 DNA拷貝數增加可能與 DAC去甲基化作用有關。隨著濃度增加,DAC引起線粒體 DNA損傷,使線粒體DNA拷貝數減少,抵消了 DAC去甲基化作用所致的線粒體 DNA拷貝數增加的作用。因此,在高濃度 DAC作用,同步化 MDS\ue011L細胞線粒體 DNA拷貝數未見明顯改變。雖有研究報道,APC對線粒體功能有影響,但本實驗結果顯示,APC處理組與DMSO對照組相比,線粒體 DNA拷貝數無明顯的變化。ND1、ND6是已報道的兩個線粒體 DNA甲基化轉移酶參與調控的線粒體基因。低濃度 DAC對線粒體的 ND1、ND6表達無明顯影響,相比之下,高濃度 DAC可以促進兩者的表達。因氧化呼吸復合體在線粒體內裝配異??捎绊懷趸粑滊娮觽鬟f,所以高濃度 DAC通過改變線粒體基因 ND1、ND6蛋白表達、氧化呼吸復合物裝配異常,從而影響線粒體氧化呼吸電子傳遞,與對照相比,降低ROS的產生。
      綜上所述,本研究初步探討了 DAC存在細胞毒以外的其他作用,不同濃度 DAC可以影響線粒體 ROS的產生,改變線粒體 DNA拷貝數及調節線粒體基因表達等作用,為深入研究 DAC的作用機理提供理念依據。

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